Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nlgn1Q99K10 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nlgn1Q99K10 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms