Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sdcbp2Q99JZ0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms