Protein–RNA interactions for Protein: Q925J9

Med1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med1Q925J9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Med1Q925J9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Med1Q925J9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Med1Q925J9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Med1Q925J9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Med1Q925J9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Med1Q925J9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Med1Q925J9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Med1Q925J9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Med1Q925J9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Med1Q925J9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Med1Q925J9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Med1Q925J9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Med1Q925J9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Med1Q925J9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Med1Q925J9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Med1Q925J9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Med1Q925J9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms