Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rnf144aQ925F3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf144aQ925F3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms