Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spdl1Q923A2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spdl1Q923A2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms