Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prpf3Q922U1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prpf3Q922U1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms