Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atpaf2Q91YY4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Atpaf2Q91YY4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atpaf2Q91YY4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atpaf2Q91YY4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atpaf2Q91YY4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atpaf2Q91YY4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms