Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha12Q91Y18 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms