Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM3

Rrp9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp9Q91WM3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrp9Q91WM3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp9Q91WM3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp9Q91WM3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms