Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep57l1Q8VDS7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep57l1Q8VDS7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms