Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDD8

Washc1, WASH complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc1Q8VDD8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Washc1Q8VDD8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Washc1Q8VDD8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Washc1Q8VDD8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Washc1Q8VDD8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Washc1Q8VDD8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Washc1Q8VDD8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms