Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg10Q8R1P4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atg10Q8R1P4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms