Protein–RNA interactions for Protein: Q8K348

Acvr1c, Activin receptor type-1C, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1cQ8K348 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acvr1cQ8K348 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acvr1cQ8K348 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acvr1cQ8K348 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acvr1cQ8K348 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acvr1cQ8K348 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acvr1cQ8K348 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acvr1cQ8K348 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acvr1cQ8K348 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acvr1cQ8K348 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acvr1cQ8K348 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acvr1cQ8K348 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acvr1cQ8K348 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acvr1cQ8K348 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acvr1cQ8K348 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Acvr1cQ8K348 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acvr1cQ8K348 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acvr1cQ8K348 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acvr1cQ8K348 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acvr1cQ8K348 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acvr1cQ8K348 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acvr1cQ8K348 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acvr1cQ8K348 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Acvr1cQ8K348 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms