Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf13Q8K2W6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf13Q8K2W6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf13Q8K2W6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf13Q8K2W6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf13Q8K2W6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf13Q8K2W6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms