Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shtn1Q8K2Q9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shtn1Q8K2Q9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms