Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Spire2Q8K1S6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spire2Q8K1S6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spire2Q8K1S6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Spire2Q8K1S6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spire2Q8K1S6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Spire2Q8K1S6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spire2Q8K1S6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spire2Q8K1S6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Spire2Q8K1S6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spire2Q8K1S6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spire2Q8K1S6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229.1 ms