Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sde2Q8K1J5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms