Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a8Q8JZR6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a8Q8JZR6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a8Q8JZR6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a8Q8JZR6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a8Q8JZR6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a8Q8JZR6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a8Q8JZR6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a8Q8JZR6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a8Q8JZR6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc4a8Q8JZR6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc4a8Q8JZR6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc4a8Q8JZR6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc4a8Q8JZR6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc4a8Q8JZR6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc4a8Q8JZR6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc4a8Q8JZR6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc4a8Q8JZR6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc4a8Q8JZR6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc4a8Q8JZR6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc4a8Q8JZR6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc4a8Q8JZR6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms