Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Card11Q8CIS0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Card11Q8CIS0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Card11Q8CIS0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Card11Q8CIS0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Card11Q8CIS0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Card11Q8CIS0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Card11Q8CIS0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Card11Q8CIS0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Card11Q8CIS0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Card11Q8CIS0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms