Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp27Q8CEG8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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