Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
E4f1Q8CCE9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E4f1Q8CCE9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E4f1Q8CCE9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms