Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Spef2Q8C9J3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Spef2Q8C9J3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Spef2Q8C9J3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms