Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppfibp1Q8C8U0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppfibp1Q8C8U0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms