Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Alx1Q8C8B0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Alx1Q8C8B0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms