Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6L9

Gm6367, Predicted gene 6367, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6367Q8C6L9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6367Q8C6L9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm6367Q8C6L9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6367Q8C6L9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms