Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933409G03RikQ8C5U0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.7 ms