Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Y1

Tgif2, Homeobox protein TGIF2, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif2Q8C0Y1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgif2Q8C0Y1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgif2Q8C0Y1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgif2Q8C0Y1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgif2Q8C0Y1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgif2Q8C0Y1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgif2Q8C0Y1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tgif2Q8C0Y1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgif2Q8C0Y1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgif2Q8C0Y1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgif2Q8C0Y1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tgif2Q8C0Y1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tgif2Q8C0Y1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms