Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nek11Q8C0Q4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nek11Q8C0Q4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
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