Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc30Q8BVF4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc30Q8BVF4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc30Q8BVF4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc30Q8BVF4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms