Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop53Q8BK35 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop53Q8BK35 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms