Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK06

Fbxo9, F-box only protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo9Q8BK06 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo9Q8BK06 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxo9Q8BK06 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo9Q8BK06 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms