Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
6820408C15RikQ8BJX2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
6820408C15RikQ8BJX2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms