Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW9

Chtf18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chtf18Q8BIW9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chtf18Q8BIW9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chtf18Q8BIW9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chtf18Q8BIW9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chtf18Q8BIW9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chtf18Q8BIW9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chtf18Q8BIW9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chtf18Q8BIW9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chtf18Q8BIW9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chtf18Q8BIW9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chtf18Q8BIW9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chtf18Q8BIW9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chtf18Q8BIW9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Chtf18Q8BIW9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chtf18Q8BIW9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chtf18Q8BIW9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chtf18Q8BIW9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chtf18Q8BIW9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chtf18Q8BIW9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chtf18Q8BIW9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chtf18Q8BIW9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chtf18Q8BIW9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chtf18Q8BIW9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms