Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW1

Fto, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FtoQ8BGW1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FtoQ8BGW1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FtoQ8BGW1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FtoQ8BGW1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FtoQ8BGW1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FtoQ8BGW1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FtoQ8BGW1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FtoQ8BGW1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FtoQ8BGW1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FtoQ8BGW1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FtoQ8BGW1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FtoQ8BGW1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms