Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp4f39Q8BGU0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms