Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Srgap3Q812A2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Srgap3Q812A2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms