Protein–RNA interactions for Protein: Q811G0

Bbs9, Protein PTHB1, mousemouse

Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs9Q811G0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bbs9Q811G0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bbs9Q811G0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bbs9Q811G0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms