Protein–RNA interactions for Protein: Q80WG5

Lrrc8a, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8aQ80WG5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc8aQ80WG5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc8aQ80WG5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms