Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc93Q7TQK5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc93Q7TQK5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms