Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SugctQ7TNE1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SugctQ7TNE1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SugctQ7TNE1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms