Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TwistnbQ78WZ7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TwistnbQ78WZ7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TwistnbQ78WZ7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms