Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RfflQ6ZQM0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 237.7 ms