Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot1Q6ZQ08 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnot1Q6ZQ08 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms