Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms