Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY53

AY358078, HN1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY358078Q6UY53 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.4 ms