Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp8b3Q6UQ17 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp8b3Q6UQ17 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp8b3Q6UQ17 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp8b3Q6UQ17 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp8b3Q6UQ17 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp8b3Q6UQ17 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp8b3Q6UQ17 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp8b3Q6UQ17 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp8b3Q6UQ17 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp8b3Q6UQ17 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp8b3Q6UQ17 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp8b3Q6UQ17 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp8b3Q6UQ17 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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