Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Casc1Q6TDU8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casc1Q6TDU8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms