Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja6Q6S5G4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.7 ms