Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5N8

Tlr13, Toll-like receptor 13, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr13Q6R5N8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr13Q6R5N8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms