Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGG2

Gmip, GEM-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmipQ6PGG2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GmipQ6PGG2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GmipQ6PGG2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GmipQ6PGG2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GmipQ6PGG2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GmipQ6PGG2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GmipQ6PGG2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GmipQ6PGG2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GmipQ6PGG2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GmipQ6PGG2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GmipQ6PGG2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GmipQ6PGG2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms